Arti, я так поняла, что речь шла о микробной порче. Просто встречала уже не раз мнение, что дистиллированная вода "чистая" - видимо путают с пастеризацией или стерилизацией.
А в плане ионов - конечно. Если использовать недистиллированную воду, то надо это учитывать в рецептуре.