fokacha, Вы на пшеничном эмульгирующем воске делаете?.. Первый раз слышу, чтобы он при достаточном нагреве не до конца расходился А что-то еще с маслами и воском греете? Возможно, это не от воска вкрапления.
Неоднородность крема - это нарушение технологии, недомесы-недогревы-пропорции и т.п. Напишите более подробно: состав, что в какой последовательности делали - будет понятнее.