Нам в роддоме помимо соды рекомендовали ещё раствор нистатина, причём смазывать им не только ротик, но и соски, если кормите грудью. После заживления можно смазывать ещё пару дней для закрепления результата. Но надо быть на 100% уверенным, что это именно молочница, а не грибковый стоматит, который тоже бывает у новорожденных.