Вообще плохо то, что вы позволили ему доорать. Надо было сразу сказать при чем жестко: "Не надо разговаривать со мной в таком тоне. Скажите, пожалуйста, какими конкретно моими профессиональным обязанностями я по-вашему, принебрегла? Опоздала? Хорошо, я напишу объяснительную".
На данный момент если вы хотите остаться на этой работе, то я бы подошла к начальнику в понедельник и спокойно сказала: "В пятницу вы повысили на меня голос. Это отразилось на моем внутреннем состоянии. Просьба впредь говорить со мной в тоне, предусмотренном для официальных отношений". Ну или что-то такое. Только коротко и без препирательств. Просто чтоб он имел это в виду и все.
Или в письменном виде изложите все это в виде служебной записки, с просьбой, например, предоставить вам отпуск на недельку для восстановления моральных сил.